75所教育部直属高校在官网公布了2021年的经费预算，其中有13所高校的经费预算超百亿，其中，清华大学年度总预算最多，其次是浙江大学，北京大学居第三。
超过百亿的高校还有中山大学(198.55亿元)、上海交通大学(175.65亿元)、复旦大学(141.62亿元)、山东大学(118.08亿元)、华中科技大学(116.33亿元)、西安交通大学(114.68亿元)、东南大学(113.92亿元)、同济大学(107.04亿元)、武汉大学(106.44亿元)和四川大学(101.76亿元)。
需要说明的是，中国矿业大学、中国石油大学、中国地质大学均为2所高校统计;华北电力大学为北京校区和保定校区合计。哈尔滨工业大学、北京航空航天大学、西北工业大学等工信部直属高校以及国科大、中科大等中国科学院直属高校以及其他部委院校不在本文的统计范围之内。根据教育部《关于部属高校公开部门预算的通知》要求，教育部直属高校均应在一定期间内公布其经费预算，以回应社会关切。
