闽南师范大学是本科批次的大学。自2020年，福建本科一批、二批合并为本科批次，取消了本科一批和本科二批的分别。如果闽南师范大学在考试所在的省份是本科二批招生的话，也可以说闽南师范大学是二本大学。
重点学科
省级重点实验室：粒计算及其应用重点实验室、现代分离分析科学与技术重点实验室、认知与人格重点实验室
省部级人文社科基地：海峡两岸闽南文化研习交流基地、闽台区域文化与文学研究中心
福建省社会科学研究基地：闽南文化研究中心
省级2011协同创新计划项目：区域农村教师发展协同创新中心
科研创新平台：现代分离分析科学与技术重点实验室、 粒计算重点实验室、菌物产业工程技术中心、文化诗学研究所、应用心理学研究所、闽南文化研究院
截至2018年10月，学校拥有国家级特色专业1个、国家级专业综合改革试点项目1项、国家级创新教师培养模式示范项目1项、国家级校外实践教育基地1个;省级专业综合改革试点项目8项，省级特色专业5个;主持省级重大教育教学改革项目2项。省级教学团队5个，省级人才培养模式改革创新实验区7个，省级应用型专业群试点项目5个(其中示范性应用型专业群2个)，省级服务产业特色专业9个，省级精品课程、在线课程共27门，省级实验教学示范中心16个。
